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转录与代谢组学联合分析克拉霉素对羊角月牙藻生长的影响效应
发布时间:2021-12-28     浏览量:

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【论文题目】 Integrative analyses of transcriptomics and metabolomics in Raphidocelis subcapitata treated with clarithromycin

【发表期刊】Chemosphere

【期刊分区】中科院SCI二区TOP(IF=7.086)

【来源网站】https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2020.128933

克拉霉素作为一种大环内酯类抗生素,在全球地表水和污水处理厂废水中被广泛检出,对水生生态系统造成了较高的生态风险。然而,抗生素对藻类生长抑制效应的机制仍然未知。本研究将羊角月牙藻暴露于浓度为 0 μg L-1、3 μg L-1(低)、10 μg L-1(高)的克拉霉素中,培养7天后对所有处理组进行转录组和代谢组学联合分析。抗生素处理组中发现了115、1833个差异表达基因(DEGs)及 134、 84种差异累积代谢物 (DAMs)。具体而言,与异生物质代谢、电子传递和能量合成相关的 DEG 和 DAM 的表达水平失调,导致产生活性氧。为应对抗生素诱导的损伤,低浓度组中绿藻的不饱和脂肪酸和类胡萝卜素的生物合成被上调;尽管抗生素组的光合作用均上调,但这两组的能量合成和抗活性氧能力均下调。

该成果受国家自然科学基金、陕西省青年千人计划等项目的支持。已在环境科学与生态学领域 TOP 期刊《Chemosphere》上发表。



图1  克拉霉素暴露后绿藻体内的GO富集分析


图2 转录与代谢组联合解析克拉霉素对绿藻光合作用的影响机制